Ametyst występuje w złożach hydrotermalnych, tworząc wypełnienia żył lub geod. Spotykany jest również w okruchowych zlożach aluwialnych. Najczęściej występuje w formie szczotek krystalicznych w pustkach skalnych (geodach, druzach, szczelinach). Wykształca skupienia zbite i ziarniste.
Nierzadkie są w przyrodzie kryształy bliźniacze ametystu nazywane bliźniakami delfinackimi lub brazylijskimi, w zależności od położenia płaszczyzny zrostu.
Świat:
Brazylia – Minas Gerias,
występują tam jedne z największych geod zawierających ametysty. Zdarzają się geody o wysokości ćwierć metra i wadze do 70 kg.
Rosja – Mursinka w pobliżu Jekaterynburga, Syberia, Góry Adun-Cziłon, Ural,
Uralskie kamienie są we wszystkich odcieniach fioletu z czerwonym odcieniem. Odcień ten widoczny jest też przy sztucznym oświetleniu. Brazylijskie ametysty w takim świetle wydają się matowe i szare.
Austria – Maissau, Największe żyły ametystu wydobywane odkrywkowo.
Urugwaj, Iran, Cejlon, Indie, Meksyk, Zambia,
USA – Texas; Park Narodowy Yellowstone; Delaware County, Pennsylvania; Haywood County, North Carolina; Deer i Stow Hill, Maine,
Zambia – roczna produkcja wynosi około 1000 ton
Kanada – Ontario, w różnych lokalizacjach na terenie całej Nowej Szkocji,
Sri Lanka, Madagaskar, Niemcy, Australia, Namibia, Korea Południowa
Polska:
Największe złoża na Dolnym Śląsku:
Szklarska Poręba, Dolina Złotego Potoku, pod Szrenicą, Kletno (żyły kwarcowo – fluorytowe)
Kamienna Góra (w melafirach), Płoszczyna, Wleń, Sokołowiec, Lubiechowa (w melafirach), Głuszyca, Suszyna, Niwa, Bukowa Góra, Tłumaczów (w melafirach), Czadrów, Czarny Bór, Gorce, Borówno (w melafirach)
Nowy Kościół(w porfirach), Dynowice (w porfirach), Rzeczka w Górach Sowich (w kataklazytach), Poniatowo w okolicach Wałbrzycha (w gnejsach), Różana (w bułach agatowych),
W południowej Polsce:
Regulice (w bazaltach), Rudna (w bazaltach), Alwernia (w bazaltach), Okolice Niedzwiedziej Góry (w diabazach) Tatry – Skupniowy Upłaz (dolomity),
