Apatyt występuje prawie we wszystkich skałach magmowych. W skałach alkalicznych spotyka się złoża czystego apatytu. Największe z nich jest, na półwyspie Kola u podnóża Chibinów. W złożach tych są żyły o grubości do 200 m i długości nawet kilku kilometrów. Apatyt jest częstym składnikiem pegmatytów.
Świat:
półwysep Kola u podnóża Chibinów, Niemcy, Szwajcaria, Meksyk, Kanada, Brazylia – Minas Gerais, Birma, Sri Lanka, Boliwia, Algieria, Kenia, Tanzania, RPA, Hiszpania, Finlandia, Portugalia, Szwecja (Kirunavaara).
Polska:
Karpacz, białe i zielonawe kryształy o wielkości do 0,5 cm, pegmatyty strzegomskie strzelińskie, strzelińskich oraz pegmatyty przecinających gnejsy Gór Sowich (Michałkowa, Zagórze Śląskie, Bielawa, Kamionki, Pila-wa, Owieśno i Różana), w okolicach Bielska-Białej i Żywca.
Największe znaczenie gospodarcze mają osadowe złoża apatytu zwane fosforytami. Zawierają one ponad 50% fosforanów.
Światowe zasoby fosforytów są duże, ale nierównomiernie rozmieszczone. Największe złoża występują w Maroku – 60%, na Florydzie i Chinach. Znaczne zasoby są w Algierii, Tunezji, Egipcie, Izraelu, Arabi Saudyjskiej i Kazachstanie. Około 80% fosforytów uzyskuje się z kopalń odkrywkowych. Niektóre partie złóż są wzbogacone w uran. Obecnie metal ten jest odzyskiwany z fosforytów Florydy.
Apatyty jubilerskie:
Apatyty niebieskie
Birma, Cejlon, Brazylia
Apatyty niebieskozielone:
- Moroksyt – niebieskozielony, Arendal, południowa Norwegia
- Fluoroapatyt – Finlandia
- Apatyt hydroksylowy – Szwecja
Apatyty zielone
Indie, Kanada, Mozambik, Madagaskar, Hiszpania, Birma, Kenia, Panasqueira w Portugalii
Apatyty zielonożółte
Rodezja, Jumille (Murcia – Hiszpania)
Apatyty fioletowe i purpurowe
USA, Maine
Apatyty żółte
Meksyk: Durango, Hiszpania: Murcia, Kanada, Brazylia, Japonia (Chloropatyt)
Apatyty brązowe
Kanada
Apatytowe tygrysie oko
Apatyty bezbarwne
Birma, Włochy, Szwecja
- Kollofan – Chile, Peru, Wyspy Bożego Narodzenia
- Lazurapatyt – Syberia